學�，F(xiàn)有8個學院，即：基督教神學院、天主教神學院、法律經(jīng)濟學院、醫(yī)學院、哲學院、數(shù)學自然科學學院、農(nóng)學院和教育學院。另外設有各類校直屬研究機構(gòu)十幾個，如考古研究所、語言實驗中心、天文學研究中心等等。

波恩大學的確擁有許多校直屬科研機構(gòu)，作為對教學和研究任務的補充。它們是：弗朗茲－杜爾格爾研究所，成立于1966年，研究古希臘羅馬后期情況，尤其是地中海

古代文化的過渡階段。研究所的許多工作人員都是來自外國的專家。舊天主教神學研究班，成立于1901年，由主教研究班和波恩舊天主教教堂資助，是德國迄今為止唯一的舊天主教研究機構(gòu)，它致力于培養(yǎng)舊天主教教學和研究的后備力量。東方語言研究班，成立至今才25年，它對于波恩大學，這所曾位于德國政治中心的高校來說，尤其具有特殊意義。自1979年來，它在經(jīng)濟上一直受到聯(lián)邦政府和北萊茵-威斯特法倫州的資助，主要從事近東、中東、遠東語言文化人才的培養(yǎng)。1983年，研究所還開設了土耳其語、日語、漢語、朝鮮語、印度語和阿拉伯語的筆譯課程。法國文化研究中心是法國使館于1952年成立的。它的師資力量和研究人員及活動經(jīng)費大部分得到法國外交部的資助。中心建立目的在于促進德法兩國互相諒解和兩國學生、學者、作家和藝術(shù)工作者的交流。目前工作重心是加強波恩大學法國語言和文學教學和研究水平。計劃用水法研究所是德國唯一致力于用水平衡法和水利法的實施的科研機構(gòu)。它通過指導和建議不斷對聯(lián)邦和州立法機關(guān)施加影響，使水法實施條件不斷改善，同時它還負責水利法的推廣和研究。銀行儲存和貸款研究所主要從事銀行儲蓄、利息、貸款和結(jié)算的研究工作。

與波恩大學有著密切聯(lián)系的馬克斯-普蘭克研究協(xié)會在全球享有極高的威望，主要從事自然科學研究。研究協(xié)會有兩個研究中心：馬克斯-普蘭克-射電天文學研究中心，致力于太陽系、銀河系和外空間射電源的研究，并擁有世界上最大最先進的射電望遠鏡；馬克斯-普蘭克數(shù)學研究中心成立于1982年，它的主要課題是研究理論數(shù)學。

和醫(yī)學院有關(guān)的幾個研究單位是全國醫(yī)學實驗和放射助理學校（從事微生物和免疫學研究）、病人護理學校、兒童護理學校和病人護救學校等。

在德國，“大學城”是波恩市的代名詞。隨著德國首都北遷入柏林，波恩將進一步朝文化性多功能的城市發(fā)展，這無疑為波恩大學學術(shù)研究提供了機會。