波恩大學(xué)并非校園式大學(xué)，而是各個建筑分布于整個城市內(nèi)。大學(xué)主樓即前科隆選帝侯宮殿位于市中心，該地區(qū)分布著一些現(xiàn)代建筑如法學(xué)院，神學(xué)院和哲學(xué)院等。
自然學(xué)科主要集中在泊波爾多夫區(qū)，以泊波爾多夫?qū)m殿和其他一些19世紀(jì)建筑，以及一些新建的現(xiàn)代建筑作為辦公樓。泊波爾多夫?qū)m殿花園自1819年作為植物園而存在。計算機學(xué)科分布在兩個位置：老的供給中心和國家機關(guān)樓（前警察總部等）。心理學(xué)位于城北的LVR醫(yī)院。醫(yī)藥學(xué)位于維努斯貝格。個別機構(gòu)和設(shè)施分布在其他城區(qū)，如天文學(xué)，化學(xué)和部分醫(yī)藥學(xué)等。
波恩大學(xué)四個校區(qū)在波恩市分布如下：
Campus City (Hauptgebude, Juridicum)
市中心校區(qū)（主樓，法學(xué)院）
Campus Poppelsdorf
泊波爾多夫校區(qū)
Campus Endenich
安德尼希校區(qū)
Bonn-Venusberg (Universit?tsklinikum)
維努斯貝格校區(qū)（大學(xué)醫(yī)學(xué)部）
總體而言大學(xué)擁有371幢建筑，2座宮殿和58座圖書館。除了教學(xué)和行政自用還包括由學(xué)生服務(wù)中心負(fù)責(zé)的4個食堂和34棟學(xué)生宿舍約4200間房間。
