該校始建于1845年10月10日，由當時的海軍部長喬治·班克羅夫特創(chuàng)建，當時校園僅占10英畝土地。
1950年7月1日正式定名為美國海軍軍官學校。學校采用新的課程體系，學制4年。校園面積擴大到338英畝。
美國內(nèi)戰(zhàn)爆發(fā)后，1861年5月13日，海軍軍官學校奉命遷往羅德島州的紐波特。
直到1865年6月22日，經(jīng)國會批準，海軍軍官學校才又遷回到安納波利斯。
主要建筑物始建于1899年，采用文藝復(fù)興時期的風格。其后經(jīng)歷年擴建，已成為美國西海岸最著名的建筑群之一。
1930年10月25日，美國大學聯(lián)合會接納了該校。
1932年國會通過立法，授權(quán)該校授子畢業(yè)學員學士學位。
1933年5月，美國國會授權(quán)海軍軍官學校校長向自接納之日起的該校畢業(yè)生授予理學學士學位。
1937年，國會又將這一榮譽澤及自該校成立以來所有活著的畢業(yè)生。該校長期以來被列入全美最著名的50所高校之一。
1963年，聯(lián)邦政府指定該校校舍為國家歷史文物。每年來此觀光的游客達100萬以上，主要建筑物有：號稱世界最大宿舍樓的班克羅夫特大樓，是學員生活樓，每個房間住2～3名學員。
1975年10月，國會授權(quán)該校招收女學員。目前該校在校學員達4500人。
1976年，美國國會批準所有軍種院校對婦女開放，海軍軍官學校也開始接受女性學員。
目前，該校在校學員達4500人。女性學員一般約占新生的15～18%，她們與男學員攻讀同樣的學業(yè)課程，接受同樣的職業(yè)訓練。
