波茨坦大學(xué)下屬五個學(xué)院：
法學(xué)院
法學(xué)院的課程包括了成為一名完全法官（德語：Volljurist）所需的全部基礎(chǔ)和必修科目，以及民法、刑法和公共法等。
法學(xué)院的教研重點是法律基礎(chǔ)、民事司法制度、經(jīng)濟法、國際法、公共行政，以及經(jīng)濟、稅務(wù)、和環(huán)境刑法。此外還有區(qū)域發(fā)展學(xué)（Kommunalwissenschaft）系為區(qū)域發(fā)展領(lǐng)域提供的其他培訓(xùn)和進修，以及人類法律中心（MenschenRechtsZentrum）提供的國際關(guān)系課程。
法學(xué)院的一個全國特色專業(yè)，是和法國巴黎拉德芳斯的巴黎第十大學(xué)合作設(shè)置的“德-法法學(xué)專業(yè)”。此專業(yè)不僅提供交流項目，還在第一、二學(xué)年，為學(xué)生提供學(xué)習(xí)法國法律的機會。有關(guān)法國法律的課程，會由法國客座講師用法語教授。
哲學(xué)學(xué)院
哲學(xué)學(xué)院由神學(xué)、猶太學(xué)、哲學(xué)、歷史學(xué)、精典語言學(xué)、日耳曼語言文學(xué)、英文學(xué)、美洲學(xué)、羅曼學(xué)、斯拉夫?qū)W以及藝術(shù)和媒體專業(yè)組成。這些專業(yè)的重點研究主題，涵蓋了文化變遷、生活方式、生活哲學(xué)、以及在歐洲的地域性和同一性等層面。
人類學(xué)學(xué)院
經(jīng)濟和社會科學(xué)學(xué)院由企業(yè)和國民經(jīng)濟學(xué)、政治學(xué)、管理學(xué)和社會學(xué)系組成。其他教研重點包括革新和技術(shù)領(lǐng)域。
數(shù)學(xué)和自然科學(xué)學(xué)院
由生物化學(xué)、生物學(xué)、化學(xué)、食品科學(xué)、地理學(xué)、地球和環(huán)境科學(xué)、信息學(xué)、數(shù)學(xué)、物理學(xué)、天文學(xué)系，以及波茨坦植物園。重要的專業(yè)有地理生態(tài)學(xué)、地理科學(xué)、食品科學(xué)、高分子科學(xué)和軟件系統(tǒng)工程。
