大學(xué)的教學(xué)單位現(xiàn)分為20個(gè)學(xué)院，這些
學(xué)院中又分為總共178個(gè)研究所，以及為醫(yī)學(xué)院實(shí)習(xí)用的診所。慕尼黑大學(xué)成就較高的學(xué)院主要有國民經(jīng)濟(jì)學(xué)院、企業(yè)經(jīng)濟(jì)學(xué)院、醫(yī)學(xué)院、法學(xué)院、社會(huì)學(xué)學(xué)院、物理學(xué)院和化學(xué)學(xué)院、林學(xué)院、獸醫(yī)學(xué)院等。幾乎涵蓋了所有的學(xué)科領(lǐng)域。因此，慕尼黑大學(xué)實(shí)為傳統(tǒng)定義下名副其實(shí)的綜合性大學(xué)“universitas”。
01 天主教神學(xué)院
02 基督教神學(xué)院
03 法學(xué)院
04 企業(yè)經(jīng)濟(jì)學(xué)院
05 國民經(jīng)濟(jì)學(xué)院
07 醫(yī)學(xué)院（包括牙醫(yī)學(xué)）
08 獸醫(yī)學(xué)院
09 歷史及藝術(shù)學(xué)院
10 哲學(xué)，科學(xué)理論及宗教學(xué)院
11 心理學(xué)及教育學(xué)院
12 文化學(xué)院
13/14 語言學(xué)及文學(xué)院
15 社會(huì)學(xué)院
16 數(shù)學(xué)，信息學(xué)及統(tǒng)計(jì)學(xué)院
17 物理學(xué)院
18 化學(xué)及藥學(xué)院
19 生物學(xué)院
20 地質(zhì)學(xué)院
