在威廉姆斯建立之初，一度經(jīng)營困難。威廉姆斯上校在馬薩諸塞州最北端擁有一片土地，準確地說，是片荒地。這個地方除了把守的軍隊，一無所有。要在荒地上建大學？遺產(chǎn)執(zhí)行人都不相信自己有這個本事，在最開始的幾年，他們想的最多的不是如何經(jīng)營這所學校，而是怎么關門大吉。
1819 年，學校投資人希望把威廉姆斯學院遷移到南安普頓。就在威廉姆斯學院生死存亡的關頭，一些社會機構和個人開始捐助威廉姆斯學院。靠著這些捐贈，學校勉強能招生。而正是看到了公眾對于威廉姆斯學院的支持，兩年之后，遷移學校的提議遭到了議會的否決。校長摩爾因此憤然出走，“地理位置？贊助？入學率？這所學校要什么沒什么！”他帶走了一群學生，翻過群山，來到了康涅狄格河谷。在這里，摩爾校長創(chuàng)辦了艾姆赫斯特學院。日后，威廉姆斯學院和阿默斯特學院成為美國最頂尖的兩所文理學院，在福布斯美國大學排行榜上，阿默斯特學院位列第三。
校長的出走，使得威廉姆斯學院再次陷入危機之中，就在此時校友們站了出來。1821 年，一群畢業(yè)了的校友在威廉姆斯鎮(zhèn)集合，成立了校友會。決心為學校未來的發(fā)展而貢獻財富。威廉姆斯校友會因此是歷史上最早成立的校友會。
1859 年，恢復元氣的威廉姆斯和成立不久的艾姆赫斯特進行了美國第一次校際棒球賽，開創(chuàng)了校際體育對抗的先河，并延續(xù)至今。威廉姆斯學院還是美國第一所使用畢業(yè)典禮和學士畢業(yè)服裝的學校。
1970 年，威廉姆斯學院由單一男校變?yōu)槟信旌闲�。盡管已經(jīng)度過了217 歲的生日，但是威廉姆斯學院仍然保留了許多來自英國教育制度的優(yōu)點，比如導師責任制度等等 [4] 。
