芝加哥大學設有12個科研機構和113個研究中心，學校管理或聯(lián)合運營的著名研究機構有：

- 美國阿貢國家實驗室（Argonne National Laboratory）；

- 美國費米實驗室（Fermi National Laboratory）；

- 新墨西哥州阿帕奇點天文臺（ApachePointObservatory ）；

- 恩利克·費米研究所（Enrico Fermi Institute） ；

- 詹姆斯·弗蘭克研究所（James Franck Institute）  ；

- Kavli 宇宙學研究所 （Kavli Institute for Cosmological Physics）；

- 芝加哥豐田科技學院（Toyota Technological Institute at Chicago）；

- 馬薩諸塞州伍茲霍爾海洋生物學實驗室（Woods Hole Marine Biological Laboratory）；

- 國家民意研究中心（National Opinion Research Center）；

- 人口研究中心（Population Research Ceter)

芝大還坐擁多座全美國一流的圖書館、博物館和芝加哥大學出版社，為學生提供了大量學術資源。

1）圖書館

芝加哥大學圖書館是世界上最大且收藏量最豐富的圖書館之一，由六個圖書館組成：D‘Angelo Law Library、Eckhart Library、John Crerar Library、Joseph Regenstein Library、Social Services Administration Library和William Rainey Harper Library。 印刷品超過850萬冊，且每年的增長速度為15萬冊；42萬冊的地圖和航空照片；還有大量的微縮資料；稀有書籍；電子圖書館為大家提供了更便捷的尋找資料的途徑，通過電腦網(wǎng)絡，可以找到所有的目錄、網(wǎng)頁、索引、電子地圖、影像資料。

2）博物館

芝加哥大學擁有多座博物館。其中“東方研究所博物館（The Oriental Institute Museum）”收藏并展示了大量古代近東的歷史、藝術和考古成果的博物館，其內(nèi)容涉及古埃及、努比亞（Nubia）、美索不達米亞（Mesopotamia）、敘利亞（Syria）、安那托利亞（Anatolia）和Megiddo（位于今天以色列的一個丘陵地區(qū)）。著名的《奪寶奇兵》系列探險電影便是以該博物館為素材，影片中的主人公印第安納瓊斯就畢業(yè)于芝加哥大學并獲得考古學博士學位。

“斯馬特美術館（Smart Museum of Art）”于1974年開館，收藏有一萬件文物，時間跨越千年，東、西方文物均有 ；已經(jīng)展出的文物以西方繪畫為主，有油畫、木刻、素描、雕塑等，還有中國的漢代陶俑、唐三彩等。

芝加哥科學與工業(yè)博物館（The Museum of Science and Industry）是世界上最大的科學博物館之一、西半球最大的科學博物館。 科學與工業(yè)博物館于1933年建立，前身是1893年芝加哥哥倫布紀念博覽會（World’s Columbian Exposition, 又名芝加哥世博會）所建立的藝術宮（Palace of Fine Arts），擁有超過3.5萬展品和展覽項目，其中包括德國二戰(zhàn)期間U-505 潛艇（美國唯一一艘德國的U系列潛艇）。截止2015年，已經(jīng)有超過1億8千萬人次從世界各地來此參觀。

3）出版社

截止至2015年，芝加哥大學出版社一直是全美規(guī)模最大的大學出版社，印發(fā)了大量學術著作和期刊。 自1891年成立至今，已經(jīng)發(fā)行了超過一萬種書籍，包括《科學革命的結構》、《大河之戀》以及經(jīng)濟學大師哈耶克的《通往奴役之路》等等。期等刊部發(fā)行41個期刊和7個年刊，涵蓋社科、人文、教育、生物、醫(yī)學、數(shù)理等多個領域，包括著名的《美國社會學期刊》（American Journal of Sociology）和《法律與經(jīng)濟學期刊》（Journal of Law & Economics）等等。而由出版社編輯們于學校創(chuàng)立之初（1906年）撰寫的《芝加哥手冊》（The Chicago Manual of Style）也產(chǎn)生了深遠的影響——手冊至今已發(fā)行了第16版（2010年），不僅成為了出版發(fā)行業(yè)內(nèi)的文本編輯標準，也是世界英文寫作的經(jīng)典的風格之一。