該校以法學院較負盛名（《美國新聞與世界報道》法學院排名: 79）（U.S. Newsrank: 70），在破產法方面卓有聲望。獨立且專門的藥學院更為其一大特點，在美東地區(qū)是一個少有的較有聲譽的專門藥學院，也是紐約附近唯一的一所高質量的藥學院。值得一提的是，圣約翰大學的商學院研究所亦獲得AACSBInternational認證（全美共406所通過認可），該院有80年的歷史，提供商科的學士和碩士學位，以及MBA學位和各種專業(yè)的證書課程，在精算方面尤為突出。圣約翰大學的商學院在紐約地區(qū)頗具名望，其課程設置結合了先進科技、實踐經驗、扎實的知識基礎、以及全球化的視野。商學院的教師致力于應用研究的同時，也把最新的商業(yè)發(fā)展動向帶入了課堂。學院下設多個院系，包括：會計和稅收、計算機信息系統(tǒng)和決策學、經濟學和金融、商法、管理、市場、風險管理、保險和審計學。MBA項目具有自己的特色，MBA學生可以選擇多個專業(yè)方向：會計、稅收、決策學、金融、保險金融管理、國際商務、國際金融、風險管理、市場管理、計算機信息系統(tǒng)，等等。

圣約翰大學的風險管理與保險專業(yè) 在2017年“保險與風險管理專業(yè) 全美最佳15所大學”調查中，位列全國第二。

根據《美國新聞與世界報道》全美大學評鑒，圣約翰大學近年在“全國性綜合大學”（national universities）的分類中，排名屬于約100-150名左右）。其中法學院位列專業(yè)排名74名。另外，每年都被選入由Prinston Review年出版的<The Best 373 Colleges,美國最好的373所大學>。

根據2015年的《商業(yè)內部新聞》雜志調查，圣約翰大學屬于全美被低估的15所大學之一，也就是說它的實際教育價值遠超在外的排名。

2010年 《華爾街日報》將圣約翰大學評為“盡全力為學生提供就業(yè)指導和職業(yè)發(fā)展”的100所大學之一。

其亞洲研究中心及亞洲研究所（又稱孫逸仙研究所）為 中國臺灣地區(qū)政府于1970年代資助設立，為紐約地區(qū)研究中國及東亞文明研究的一大重鎮(zhèn)；該校總圖書館仍保有豐富的漢文藏書。校內的亞洲研究中心是一個中式風格的建筑。

同時，它為美東體育名校之一，屬于美國大學體育總會（NCAA）“大東區(qū)”（Big East）聯(lián)盟，強項為籃球、足球（1996 NCAA 男子組冠軍）等。特別是男子籃球隊，為美國大學傳統(tǒng)著名強隊之一。校隊原以“紅人隊”（Redmen）富有盛名，后為避諱種族聯(lián)想，改名為“紅色風暴”（Red Storm）。前NBA職業(yè)籃球員克里斯·穆林（Chris Mullin），有NBA“上帝的左手”之雅稱，為該校校友中最著名的體育界聞人之一。