帝國(guó)理工于1907年由維多利亞女王和阿爾伯特親王1845建立的皇家科學(xué)院（Royal College of Science），大英帝國(guó)研究院（The Imperial Institute），皇家礦業(yè)學(xué)院（Royal school of mines) 和倫敦基蒂戈蒂學(xué)院（City and Guilds of London Institute）合并組成，盡管這三所學(xué)院仍然在憲制上保留著自己的實(shí)體，帝國(guó)理工學(xué)院在1907年七月獲得了皇家特許狀，成為一個(gè)實(shí)際上統(tǒng)一的實(shí)體。1960年代，隨著兼并前帝國(guó)學(xué)會(huì)（Imperial Institute），南肯星頓校區(qū)基本成形。隨后，圣瑪麗醫(yī)院醫(yī)學(xué)院（1988），國(guó)家心臟和肺學(xué)會(huì)（1995），查令十字和威斯敏斯特學(xué)校（Charing Cross and Westminster schools，1997）先后并入帝國(guó)理工，組成醫(yī)學(xué)院，作為帝國(guó)理工學(xué)院的第四個(gè)憲制學(xué)院。1997年，帝國(guó)理工醫(yī)學(xué)院兼并了皇家研究生醫(yī)學(xué)院，皇家婦產(chǎn)科學(xué)會(huì)，2000年又兼并了肯尼迪風(fēng)濕病學(xué)學(xué)會(huì)。

同樣是2000年，帝國(guó)理工又兼并了并不是十分知名崴學(xué)院（Wye College）作為它的一個(gè)分校區(qū)，主要研究環(huán)境科學(xué)。人們認(rèn)為帝國(guó)理工學(xué)院的目的主要是獲得崴學(xué)院所擁有的大量土地，帝國(guó)理工學(xué)院于2005年12月6日宣布崴校區(qū)吸引了10億英鎊的投資，將被建成一個(gè)世界級(jí)能容納12,500人的生物燃料研究中心。

2002年，維持了幾十年的憲制學(xué)院系統(tǒng)被廢除，而采用了新的院系制度。

2005年底，學(xué)院宣布將合并物理科學(xué)院（Faculty of Physical Sciences）和生命科學(xué)院（Faculty of Life Sciences）組成新的自然科學(xué)院（Faculty of Natural Sciences）。

2005年12月9日，學(xué)院宣布計(jì)劃退出聯(lián)邦制的倫敦大學(xué)，并正式開(kāi)始與倫敦大學(xué)磋商相關(guān)事宜。2007年，學(xué)院成立100周年之際，正式脫離倫敦大學(xué)，成為一所獨(dú)立的大學(xué)。