馬爾堡大學(xué)由16個(gè)系組成,分別為法律系、工商管理與經(jīng)濟(jì)系、社會(huì)科學(xué)與哲學(xué)系、心理學(xué)系、新教神學(xué)系、歷史與文化研究系、德語(yǔ)研究與藝術(shù)史系、外國(guó)語(yǔ)言與文化系、數(shù)學(xué)與計(jì)算機(jī)科學(xué)系、物理系、化學(xué)系、藥學(xué)系、生物系、地理系、醫(yī)學(xué)系、教育系。
馬爾堡大學(xué)還設(shè)有性別研究中心、近東與中東研究中心等16個(gè)不同學(xué)科的研究中心。馬克斯-普朗克陸地微生物學(xué)研究所也設(shè)在馬爾堡大學(xué)。
馬爾堡大學(xué)有新舊兩座植物園,以及宗教收藏館和民族收藏館,還擁有四個(gè)博物館:圖像藝術(shù)博物館、文化歷史博物館、解剖學(xué)博物館和礦物博物館。